Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcf1Q9CTH6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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