Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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