Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifitm3Q9CQW9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifitm3Q9CQW9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms