Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PompQ9CQT5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms