Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms