Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQC3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQC3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms