Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp3Q9CQ10 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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