Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms