Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Emc3Q99KI3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Emc3Q99KI3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms