Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdcbp2Q99JZ0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms