Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smarca5Q91ZW3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms