Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms