Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Krt79Q8VED5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Krt79Q8VED5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Krt79Q8VED5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Krt79Q8VED5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Krt79Q8VED5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Krt79Q8VED5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt79Q8VED5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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