Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc39cQ8VE09 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39cQ8VE09 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms