Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rprd1aQ8VDS4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms