Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApobrQ8VBT6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms