Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r200Q8R281 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r200Q8R281 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r200Q8R281 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r200Q8R281 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r200Q8R281 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r200Q8R281 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r200Q8R281 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r200Q8R281 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r200Q8R281 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r200Q8R281 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vmn1r200Q8R281 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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