Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Brd3Q8K2F0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms