Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek9Q8K1R7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek9Q8K1R7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek9Q8K1R7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek9Q8K1R7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek9Q8K1R7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek9Q8K1R7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek9Q8K1R7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek9Q8K1R7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms