Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms