Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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