Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms