Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Snx17Q8BVL3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx17Q8BVL3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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