Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cops7bQ8BV13 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cops7bQ8BV13 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Cops7bQ8BV13 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7bQ8BV13 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cops7bQ8BV13 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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