Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik4Q8BMF5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms