Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubash3bQ8BGG7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms