Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms