Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Liat1Q810M6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms