Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRCQ7RTU9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STRCQ7RTU9 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms