Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GypcQ78HU7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms