Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps27Q6ZWU9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms