Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Glis3Q6XP49 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms