Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Atp8b3Q6UQ17 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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Atp8b3Q6UQ17 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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Atp8b3Q6UQ17 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atp8b3Q6UQ17 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Atp8b3Q6UQ17 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Atp8b3Q6UQ17 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Atp8b3Q6UQ17 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b3Q6UQ17 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms