Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms