Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Arhgap20Q6IFT4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Arhgap20Q6IFT4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Arhgap20Q6IFT4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Arhgap20Q6IFT4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Arhgap20Q6IFT4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Arhgap20Q6IFT4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Arhgap20Q6IFT4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Arhgap20Q6IFT4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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