Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Six2Q62232 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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