Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Lrrn1Q61809 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Lrrn1Q61809 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Lrrn1Q61809 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Lrrn1Q61809 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Lrrn1Q61809 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Lrrn1Q61809 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Lrrn1Q61809 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Lrrn1Q61809 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Lrrn1Q61809 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Lrrn1Q61809 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Lrrn1Q61809 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Lrrn1Q61809 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrn1Q61809 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms