Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxj1Q61660 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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