Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pacsin1Q61644 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms