Protein–RNA interactions for Protein: Q60766

Irgm1, Immunity-related GTPase family M protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm1Q60766 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Irgm1Q60766 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Irgm1Q60766 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Irgm1Q60766 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Irgm1Q60766 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Irgm1Q60766 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Irgm1Q60766 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Irgm1Q60766 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Irgm1Q60766 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Irgm1Q60766 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Irgm1Q60766 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Irgm1Q60766 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Irgm1Q60766 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irgm1Q60766 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms