Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprnQ60673 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms