Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CttnQ60598 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms