Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uimc1Q5U5Q9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms