Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2f8Q58FA4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2f8Q58FA4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms