Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc110Q3V125 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms