Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrch2Q3UMG5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms