Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp19Q3UJD6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms