Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm648Q3UJ22 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm648Q3UJ22 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm648Q3UJ22 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm648Q3UJ22 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm648Q3UJ22 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm648Q3UJ22 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm648Q3UJ22 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm648Q3UJ22 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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