Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmod2Q3UHZ5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms