Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Wdr41Q3UDP0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms